הנדסת מכונות מהווה את התשתית לכל תעשייה מודרנית בארץ ובעולם. פריצות הדרך הטכנולוגיות האדירות, לדוגמה בתחום הרובוטיקה, משלבות בין רעיון מצוין, חשיבה מחוץ לקופסה ויכולת יישום.

המחלקה להנדסת מכונות בקמפוס באר שבע מציעה לימודי תואר ראשון בהנדסת מכונות (.B.Sc) במסלולי התמחות רובוטיקה ומערכות אוטונומיות, תיכון ועיצוב המוצר ומערכות אנרגיה.

תואר בהנדסת מכונות משלב בין יכולות מתמטיות והבנה פיזיקלית לחשיבה יצירתית וחדשנית. תכנית הלימודים הוקמה על מנת לתת מענה לצורך הגובר וההולך של התעשייה הישראלית בקליטת מהנדסי מכונות בעלי ידע בין-תחומי משולב במספר תחומים כגון: מכטרוניקה, עיצוב תעשייתי, הנדסת אנוש, מערכות אנרגיה ועוד.

מטרת תוכנית הלימודים המוצעת לתואר ראשון בהנדסת מכונות היא להקנות את הידע והכלים הנדרשים למהנדס המכונות בתחומי ההנדסה הנ"ל תוך התמקדות במספר מסלולי התמחות*:

• רובוטיקה ומערכות אוטונומיות – מקנה לבוגריה ידע רחב, בהנדסת חשמל, אלקטרוניקה, בקרה ומחשבים, רובוטיקה ואוטומציה, ושילובם, אשר יסייעו להם לעסוק בתכנון, פיתוח וייצור מערכות מכטרוניות. 
• תיכון ועיצוב המוצר - מקנה לבוגריה את היכולת לתכנן ולפתח מוצרים מתקדמים חדשניים, משלב הרעיון ועד שלב הייצור, עפ"י דרישות התעשייה ולהתאים אותם לצרכי המשתמש.
• מערכות אנרגיה – מקנה לבוגריה ידע רחב הן במערכות אנרגיה קונבנציונאליות מבוססות דלקים (נפט, גז וכו') והן במערכות אנרגיה חלופיות מבוססות אנרגיות מתחדשות (רוח, שמש, מים). מרכז המחקר לאנרגיה וסימולציות נומריות, הקיים במחלקה, ישמש כבסיס לביצוע עבודות המחקר בתחום.

במחלקה להנדסת מכונות פועל מסלול מיוחד (מותנה במספר נרשמים) לתואר ראשון לטובת אנשים עובדים בתעשייה ולאנשי קבע בצה"ל.

בנוסף, המחלקה מקיימת לימודי תואר שני (.M.Sc) בהנדסת מכונות.

*ההתמחויות לא ייכללו בתעודת סיום הלימודים